Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn34b3Q80ZS5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn34b3Q80ZS5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn34b3Q80ZS5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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