Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cracr2bQ80ZJ8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms