Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm5bQ80Y84 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5bQ80Y84 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms