Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrfn4Q80XU8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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