Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg2bQ80XK6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg2bQ80XK6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg2bQ80XK6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms