Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsm4Q80W40 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms