Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ell3Q80VR2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms