Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms