Protein–RNA interactions for Protein: Q80UB0

Testin-2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80UB0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80UB0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80UB0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80UB0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80UB0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms