Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms