Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NischQ80TM9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NischQ80TM9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms