Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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