Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LnpkQ7TQ95 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms