Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrc2bQ7TPM1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms