Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Raver2Q7TPD6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raver2Q7TPD6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms