Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms