Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg4Q7TMD7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms