Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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