Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms