Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rph3alQ768S4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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