Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SynmQ70IV5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynmQ70IV5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynmQ70IV5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynmQ70IV5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynmQ70IV5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynmQ70IV5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SynmQ70IV5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynmQ70IV5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SynmQ70IV5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SynmQ70IV5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms