Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Syne1Q6ZWR6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms