Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms