Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn5Q6VZZ7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms