Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift172Q6VH22 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms