Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timd4Q6U7R4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms