Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnip1Q6QD59 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnip1Q6QD59 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms