Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn2Q6PHP6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn2Q6PHP6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms