Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med16Q6PGF3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms