Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms