Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms