Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms