Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx6Q6P8X1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx6Q6P8X1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms