Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smchd1Q6P5D8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smchd1Q6P5D8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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