Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D4

Cep135, Centrosomal protein of 135 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep135Q6P5D4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep135Q6P5D4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep135Q6P5D4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms