Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frg2f1Q6P3A2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms