Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpdc1Q6NZK8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms