Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcbtb1Q6NXM2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rcbtb1Q6NXM2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rcbtb1Q6NXM2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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