Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc3bQ6NWW9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc3bQ6NWW9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms