Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf6Q6NVF9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms