Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wdr44Q6NVE8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms