Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CltbQ6IRU5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms