Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT9

Nomo1, Nodal modulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nomo1Q6GQT9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nomo1Q6GQT9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms