Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scaf8Q6DID3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scaf8Q6DID3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scaf8Q6DID3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scaf8Q6DID3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scaf8Q6DID3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scaf8Q6DID3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scaf8Q6DID3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms