Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbf1Q6DFZ1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbf1Q6DFZ1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbf1Q6DFZ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gbf1Q6DFZ1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gbf1Q6DFZ1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gbf1Q6DFZ1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gbf1Q6DFZ1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gbf1Q6DFZ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbf1Q6DFZ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms