Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp7Q6A4J8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp7Q6A4J8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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