Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rftn1Q6A0D4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms