Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pkp4Q68FH0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pkp4Q68FH0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pkp4Q68FH0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pkp4Q68FH0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pkp4Q68FH0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pkp4Q68FH0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pkp4Q68FH0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pkp4Q68FH0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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