Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg9aQ68FE2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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