Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CltcQ68FD5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CltcQ68FD5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms